Món Quà từ Trái Tim xoay quanh Aihara Ame, cô gái luôn gặp khó khăn trong việc mở lòng với người khác do quá khứ đau buồn và sự tự ti. Khi trở về quê hương ở Nagasaki, Ame tình cờ tái hợp với Asano Taiyo – người duy nhất mà cô tin tưởng tâm sự. Niềm vui của họ bỗng chốc tan biến khi Taiyo gặp tai nạn đe dọa mạng sống. Để cứu vãn tình yêu và sự sống của Taiyo, Ame phải đối diện với Người Dẫn Đường và chấp nhận một điều kiện khắc nghiệt để trao gửi trái tim mình đi. Câu chuyện ấm áp giữa hai con người đối lập đối diện với thách thức của phép màu và số phận được hé lộ trong Món Quà Từ Trái Tim.